Deep transcriptome profiling of mammalian stem cells supports a regulatory role for retrotransposons in pluripotency maintenance

A. Fort, K. Hashimoto, D. Yamada, M. Salimullah, C.A. A. Keya, A. Saxena, A. Bonetti, I. Voineagu, N. Bertin, A. Kratz, Y. Noro, C-H. H. Wong, M. de Hoon, R. Andersson, A. Sandelin, H. Suzuki, C-L. L. Wei, H. Koseki, Y. Hasegawa, Alistair R.R. ForrestP. Carninci, I. Alam, D. Albanese, G. Alstschuler, T. Arakawa, J. Archer, E. Arner, P. Arner, M. Babina, K. Baillie, V. Bajic, S. Baker, A. Balic, P. Balwierz, A. Beckhouse, J.A. A. Blake, A. Blumenthal, B. Bodega, J. Briggs, F. Brombacher, M. Burroughs, A. Califano, C. Cannistraci, D. Carbajo, Y. Chen, M. Chierici, Y. Ciani, H. Clevers, E. Dalla, C. Daub, C. Davis, D. de lima Morais, M. Detmar, A. Diehl, E. Dimont, T. Dohi, F. Drabros, A. Edge, M. Edinger, K. Ekwall, M. Endoh, H. Enomoto, M. Fagiolini, L. Fairbairn, H. Fang, M.C. C. Farach-Carson, G. Faulkner, A. Favorov, M. Fisher, M. Francescatto, T. Freeman, M. Frith, R. Fujita, S. Fukuda, C. Furlanello, M. Furuno, J-I. I. Furusawa, T.B.H. B.H. Geijtenbeek, A. Gibson, T. Gingeras, D. Goldowitz, J. Gough, S. Guhl, R. Guler, S. Gustincich, T. Ha, V. Haberle, M. Hamaguchi, M. Hara, M. Harbers, J. Harshbarger, A. Hasegawa, T. Hashimoto, Y. Hayashizaki, M. Herlyn, P. Heutink, W. Hide, K. Hitchens, S. Ho Sui, O. Hofmann, I. Hoof, F. Hori, D. Hume, L. Huminiecki, K. Ilda, T. Ikawa, Y. Ishizu, M. Itoh, B. Jankovic, H. Jia, M. Jorgensen, A. Joshi, G. Jurman, B. Kaczkowski, C. Kai, K. Kaida, A. Kaiho, K. Kajiyama, M. Kanamori-Katayama, A. Kasianov, T. Kasukawa, S. Katayama, S. Kato, S. Kawaguchi, J. Kawai, H. Kawaji, H. Kawamoto, Y. Kawamura, T. Kawashima, J. Kempfle, T. Kenna, J. Kere, L. Khachigian, T. Kitamura, Peter P. Klinken, A. Knox, M. Kojima, S. Kojima, N. Kondo, S. Koyasu, S. Krampitz, A. Kubosaki, I. Kulakovskiy, A.T.J. T.J. Kwon, J. Laros, T. Lassmann, B. Lenhard, A. Lennartsson, K. Li, B. Lilje, L. Lipovich, M. Lizio, A. Mackay-Sim, V. Makeev, R. Manabe, J. Mar, B. Marchand, A. Mathelier, Y. Medvedeva, T.F. F. Meehan, N. Mejhert, A. Meynert, Y. Mizuno, H. Morikawa, M. Morimoto, K. Moro, E. Motakis, H. Motohashi, C. Mummery, C.J. J. Mungall, M. Murata, S. Nagao, Y. Nakachi, F. Nakahara, T. Nakamura, K. Nakzato, N. Ninomiya, H. Nishiyori, S. Noma, T. Nozaki, S. Ogishima, N. Ohkura, H. Ohmiya, H. Ohno, M. Ohshima, M. Okada-Hatakeyama, Y. Okazaki, V. Orlando, D. Ovchinnikov, A. Pain, R. Passier, H. Persson, S. Piazza, C. Plessy, S. Pradhan-Bhatt, J. Prendergast, O. Rackham, J. Ramilowski, M. Rashid, T. Ravasi, M. Rehli, P. Rizzu, M. Roncador, S. Roy, M. Rye, E. Saijyo, A. Sajantila, A. Saka, S. Sakaguchi, M. Sakai, H. Sato, H. Satoh, S. Savvi, U. Schaefer, S. Schmeier, C. Schmidl, C. Schneider, E.A. A. Schultes, G. Schulze-Tanzil, A. Schwegmann, C. Semple, T. Sengstag, J. Severin, G. Sheng, H. Shimoji, Y. Shimoni, C. Simon, D. Sugiyama, T. Sugiyama, K. Summers, M. Suzuki, N. Suzuki, R. Swoboda, P. T Hoen, M. Tagami, N. Takahashi, J. Takai, H. Tanaka, H. Tatsukawa, Z. Tatum, M. Taylor, M. Thompson, H. Toyoda, T. Toyoda, E. Valen, M. van de Wetering, L. van den Berg, E. van Nimwegen, R. Verardo, D. Vijayan, M. Vitezic, I. Vorontzov, W. Wasserman, S. Watanbe, C. Wells, Louise Winteringham, E. Wolvetang, E.J. J. Wood, Y. Yamaguchi, M. Yamamoto, M. Yoneda, Y. Yonekura, S. Yoshida, R. Young, S.E. E. Zabierowski, P. Zhang, X. Zhao, S. Zucchelli

Research output: Contribution to journalArticle

162 Citations (Scopus)
Original languageEnglish
Pages (from-to)558-568
Number of pages11
JournalNature Genetics
Volume46
Issue number6
DOIs
Publication statusPublished - 2014

Cite this