Comparison of CAGE and RNA-seq transcriptome profiling using clonally amplified and single-molecule next generation sequencing

H. Kawaji, M. Lizio, M. Itoh, M. Kanamori-Katayama, A. Kaiho, H. Nishiyori-Sueki, J.W. W. Shin, M. Kojima-Ishiyama, M. Kawano, M. Murata, N. Ninomiya-Fukuda, S. Ishikawa-Kato, S. Nagao-Sato, S. Noma, Y. Hayashizaki, Alistair R.R. Forrest, P. Carninci, I. Alam, D. Albanese, G. AltschulerR. Andersson, T. Arakawa, J. Archer, E. Arner, P. Arner, M. Babina, K. Baillie, V. Bajic, S. Baker, A. Balic, P. Balwierz, A. Beckhouse, N. Bertin, J.A. A. Blake, A. Blumenthal, B. Bodega, A. Bonetti, J. Briggs, F. Brombacher, M. Burroughs, A. Califano, C. Cannistraci, D. Carbajo, Y. Chen, M. Chierici, Y. Ciani, H. Clevers, E. Dalla, C. Daub, C. Davis, M. de Hoon, D. de Lima Morais, M. Detmar, A. Diehl, E. Dimont, T. Dohi, F. Drabros, A. Edge, M. Edinger, K. Ekwall, M. Endoh, H. Enomoto, M. Fagiolini, L. Fairbairn, H. Fang, M.C. C. Farach-Carson, G. Faulkner, A. Favorov, M. Fisher, M. Francescatto, T. Freeman, M. Frith, R. Fujita, S. Fukuda, C. Furlanello, M. Furuno, J-I. I. Furusawa, T.B.H. B.H. Geijtenbeek, A. Gibson, T. Gingeras, D. Goldowitz, J. Gough, S. Guhl, R. Guler, S. Gustincich, T. Ha, V. Haberle, M. Hamaguchi, M. Hara, M. Harbers, J. Harshbarger, A. Hasegawa, Y. Hasegawa, T. Hashimoto, M. Herlyn, P. Heutink, W. Hide, K. Hitchens, S. Ho Sui, O. Hofmann, I. Hoof, F. Hori, D. Hume, L. Huminiecki, K. Ilda, T. Ikawa, Y. Ishizu, B. Jankovic, H. Jia, M. Jorgensen, A. Joshi, G. Jurman, B. Kaczkowski, C. Kai, K. Kaida, K. Kajiyama, A. Kasianov, T. Kasukawa, S. Katayama, S. Kawaguchi, J. Kawai, H. Kawamoto, Y. Kawamura, T. Kawashima, J. Kempfle, T. Kenna, J. Kere, L. Khachigian, T. Kitamura, Peter P. Klinken, A. Knox, S. Kojima, N. Kondo, H. Koseki, S. Koyasu, S. Krampitz, A. Kubosaki, I. Kulakovskiy, A.T.J. T.J. Kwon, J. Laros, T. Lassmann, B. Lenhard, A. Lennartsson, K. Li, B. Lilje, L. Lipovich, A. Mackay-Sim, V. Makeev, R. Manabe, J. Mar, B. Marchand, A. Mathelier, Y. Medvedeva, T.F. F. Meehan, N. Mejhert, A. Meynert, Y. Mizuno, H. Morikawa, M. Morimoto, K. Moro, E. Motakis, H. Motohashi, C. Mummery, C.J. J. Mungall, Y. Nakachi, F. Nakahara, T. Nakamura, Y. Nakamura, K. Nakazato, T. Nozaki, S. Ogishima, N. Ohkura, H. Ohmiya, H. Ohno, M. Ohshima, M. Okada-Hatakeyama, Y. Okazaki, V. Orlando, D. Ovchinnikov, A. Pain, R. Passier, H. Persson, S. Piazza, C. Plessy, S. Pradhan-Bhatt, J. Prendergast, O. Rackham, J. Ramilowski, M. Rashid, T. Ravasi, M. Rehli, P. Rizzu, M. Roncador, S. Roy, M. Rye, E. Saijyo, A. Sajantila, A. Saka, S. Sakaguchi, M. Sakai, A. Sandelin, H. Sato, H. Satoh, S. Savvi, A. Saxena, U. Schaeffer, S. Schmeier, C. Schmidl, C. Schneider, E.A. A. Schultes, G. Schulze-Tanzil, A. Schwegmann, C. Semple, T. Sengstag, J. Severin, G. Sheng, H. Shimoji, Y. Shimoni, C. Simon, D. Sugiyama, T. Sugiyama, K. Summers, H. Suzuki, N. Suzuki, R. Swoboda, P. T Hoen, M. Tagami, N. Takahashi, J. Takai, H. Tanaka, H. Tatsukawa, Z. Tatum, M. Taylor, M. Thompson, H. Toyoda, T. Toyoda, E. Valen, M. van de Wetering, L. van den Berg, E. van Nimwegen, R. Verardo, D. Vijayan, M. Vitezic, I. Vorontzov, W. Wasserman, S. Watanabe, C. Wells, Louise Winteringham, E. Wolvetang, E.J. J. Wood, Y. Yamaguchi, M. Yamamoto, M. Yoneda, Y. Yonekura, S. Yoshida, R. Young, S.E. E. Zabierowski, P. Zhang, X. Zhao, S. Zucchelli

Research output: Contribution to journalArticle

52 Citations (Scopus)
Original languageEnglish
Pages (from-to)708-717
Number of pages10
JournalGenome Research
Volume24
Issue number4
DOIs
Publication statusPublished - 2014

Cite this