| Original language | English |
|---|---|
| Pages (from-to) | 708-717 |
| Number of pages | 10 |
| Journal | Genome Research |
| Volume | 24 |
| Issue number | 4 |
| DOIs | |
| Publication status | Published - 2014 |
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Comparison of CAGE and RNA-seq transcriptome profiling using clonally amplified and single-molecule next generation sequencing. / Kawaji, H.; Lizio, M.; Itoh, M.; Kanamori-Katayama, M.; Kaiho, A.; Nishiyori-Sueki, H.; Shin, J.W. W.; Kojima-Ishiyama, M.; Kawano, M.; Murata, M.; Ninomiya-Fukuda, N.; Ishikawa-Kato, S.; Nagao-Sato, S.; Noma, S.; Hayashizaki, Y.; Forrest, Alistair R.R.; Carninci, P.; Alam, I.; Albanese, D.; Altschuler, G.; Andersson, R.; Arakawa, T.; Archer, J.; Arner, E.; Arner, P.; Babina, M.; Baillie, K.; Bajic, V.; Baker, S.; Balic, A.; Balwierz, P.; Beckhouse, A.; Bertin, N.; Blake, J.A. A.; Blumenthal, A.; Bodega, B.; Bonetti, A.; Briggs, J.; Brombacher, F.; Burroughs, M.; Califano, A.; Cannistraci, C.; Carbajo, D.; Chen, Y.; Chierici, M.; Ciani, Y.; Clevers, H.; Dalla, E.; Daub, C.; Davis, C.; de Hoon, M.; de Lima Morais, D.; Detmar, M.; Diehl, A.; Dimont, E.; Dohi, T.; Drabros, F.; Edge, A.; Edinger, M.; Ekwall, K.; Endoh, M.; Enomoto, H.; Fagiolini, M.; Fairbairn, L.; Fang, H.; Farach-Carson, M.C. C.; Faulkner, G.; Favorov, A.; Fisher, M.; Francescatto, M.; Freeman, T.; Frith, M.; Fujita, R.; Fukuda, S.; Furlanello, C.; Furuno, M.; Furusawa, J-I. I.; Geijtenbeek, T.B.H. B.H.; Gibson, A.; Gingeras, T.; Goldowitz, D.; Gough, J.; Guhl, S.; Guler, R.; Gustincich, S.; Ha, T.; Haberle, V.; Hamaguchi, M.; Hara, M.; Harbers, M.; Harshbarger, J.; Hasegawa, A.; Hasegawa, Y.; Hashimoto, T.; Herlyn, M.; Heutink, P.; Hide, W.; Hitchens, K.; Ho Sui, S.; Hofmann, O.; Hoof, I.; Hori, F.; Hume, D.; Huminiecki, L.; Ilda, K.; Ikawa, T.; Ishizu, Y.; Jankovic, B.; Jia, H.; Jorgensen, M.; Joshi, A.; Jurman, G.; Kaczkowski, B.; Kai, C.; Kaida, K.; Kajiyama, K.; Kasianov, A.; Kasukawa, T.; Katayama, S.; Kawaguchi, S.; Kawai, J.; Kawamoto, H.; Kawamura, Y.; Kawashima, T.; Kempfle, J.; Kenna, T.; Kere, J.; Khachigian, L.; Kitamura, T.; Klinken, Peter P.; Knox, A.; Kojima, S.; Kondo, N.; Koseki, H.; Koyasu, S.; Krampitz, S.; Kubosaki, A.; Kulakovskiy, I.; Kwon, A.T.J. T.J.; Laros, J.; Lassmann, T.; Lenhard, B.; Lennartsson, A.; Li, K.; Lilje, B.; Lipovich, L.; Mackay-Sim, A.; Makeev, V.; Manabe, R.; Mar, J.; Marchand, B.; Mathelier, A.; Medvedeva, Y.; Meehan, T.F. F.; Mejhert, N.; Meynert, A.; Mizuno, Y.; Morikawa, H.; Morimoto, M.; Moro, K.; Motakis, E.; Motohashi, H.; Mummery, C.; Mungall, C.J. J.; Nakachi, Y.; Nakahara, F.; Nakamura, T.; Nakamura, Y.; Nakazato, K.; Nozaki, T.; Ogishima, S.; Ohkura, N.; Ohmiya, H.; Ohno, H.; Ohshima, M.; Okada-Hatakeyama, M.; Okazaki, Y.; Orlando, V.; Ovchinnikov, D.; Pain, A.; Passier, R.; Persson, H.; Piazza, S.; Plessy, C.; Pradhan-Bhatt, S.; Prendergast, J.; Rackham, O.; Ramilowski, J.; Rashid, M.; Ravasi, T.; Rehli, M.; Rizzu, P.; Roncador, M.; Roy, S.; Rye, M.; Saijyo, E.; Sajantila, A.; Saka, A.; Sakaguchi, S.; Sakai, M.; Sandelin, A.; Sato, H.; Satoh, H.; Savvi, S.; Saxena, A.; Schaeffer, U.; Schmeier, S.; Schmidl, C.; Schneider, C.; Schultes, E.A. A.; Schulze-Tanzil, G.; Schwegmann, A.; Semple, C.; Sengstag, T.; Severin, J.; Sheng, G.; Shimoji, H.; Shimoni, Y.; Simon, C.; Sugiyama, D.; Sugiyama, T.; Summers, K.; Suzuki, H.; Suzuki, N.; Swoboda, R.; T Hoen, P.; Tagami, M.; Takahashi, N.; Takai, J.; Tanaka, H.; Tatsukawa, H.; Tatum, Z.; Taylor, M.; Thompson, M.; Toyoda, H.; Toyoda, T.; Valen, E.; van de Wetering, M.; van den Berg, L.; van Nimwegen, E.; Verardo, R.; Vijayan, D.; Vitezic, M.; Vorontzov, I.; Wasserman, W.; Watanabe, S.; Wells, C.; Winteringham, Louise; Wolvetang, E.; Wood, E.J. J.; Yamaguchi, Y.; Yamamoto, M.; Yoneda, M.; Yonekura, Y.; Yoshida, S.; Young, R.; Zabierowski, S.E. E.; Zhang, P.; Zhao, X.; Zucchelli, S.
In: Genome Research, Vol. 24, No. 4, 2014, p. 708-717.Research output: Contribution to journal › Article
TY - JOUR
T1 - Comparison of CAGE and RNA-seq transcriptome profiling using clonally amplified and single-molecule next generation sequencing
AU - Kawaji, H.
AU - Lizio, M.
AU - Itoh, M.
AU - Kanamori-Katayama, M.
AU - Kaiho, A.
AU - Nishiyori-Sueki, H.
AU - Shin, J.W. W.
AU - Kojima-Ishiyama, M.
AU - Kawano, M.
AU - Murata, M.
AU - Ninomiya-Fukuda, N.
AU - Ishikawa-Kato, S.
AU - Nagao-Sato, S.
AU - Noma, S.
AU - Hayashizaki, Y.
AU - Forrest, Alistair R.R.
AU - Carninci, P.
AU - Alam, I.
AU - Albanese, D.
AU - Altschuler, G.
AU - Andersson, R.
AU - Arakawa, T.
AU - Archer, J.
AU - Arner, E.
AU - Arner, P.
AU - Babina, M.
AU - Baillie, K.
AU - Bajic, V.
AU - Baker, S.
AU - Balic, A.
AU - Balwierz, P.
AU - Beckhouse, A.
AU - Bertin, N.
AU - Blake, J.A. A.
AU - Blumenthal, A.
AU - Bodega, B.
AU - Bonetti, A.
AU - Briggs, J.
AU - Brombacher, F.
AU - Burroughs, M.
AU - Califano, A.
AU - Cannistraci, C.
AU - Carbajo, D.
AU - Chen, Y.
AU - Chierici, M.
AU - Ciani, Y.
AU - Clevers, H.
AU - Dalla, E.
AU - Daub, C.
AU - Davis, C.
AU - de Hoon, M.
AU - de Lima Morais, D.
AU - Detmar, M.
AU - Diehl, A.
AU - Dimont, E.
AU - Dohi, T.
AU - Drabros, F.
AU - Edge, A.
AU - Edinger, M.
AU - Ekwall, K.
AU - Endoh, M.
AU - Enomoto, H.
AU - Fagiolini, M.
AU - Fairbairn, L.
AU - Fang, H.
AU - Farach-Carson, M.C. C.
AU - Faulkner, G.
AU - Favorov, A.
AU - Fisher, M.
AU - Francescatto, M.
AU - Freeman, T.
AU - Frith, M.
AU - Fujita, R.
AU - Fukuda, S.
AU - Furlanello, C.
AU - Furuno, M.
AU - Furusawa, J-I. I.
AU - Geijtenbeek, T.B.H. B.H.
AU - Gibson, A.
AU - Gingeras, T.
AU - Goldowitz, D.
AU - Gough, J.
AU - Guhl, S.
AU - Guler, R.
AU - Gustincich, S.
AU - Ha, T.
AU - Haberle, V.
AU - Hamaguchi, M.
AU - Hara, M.
AU - Harbers, M.
AU - Harshbarger, J.
AU - Hasegawa, A.
AU - Hasegawa, Y.
AU - Hashimoto, T.
AU - Herlyn, M.
AU - Heutink, P.
AU - Hide, W.
AU - Hitchens, K.
AU - Ho Sui, S.
AU - Hofmann, O.
AU - Hoof, I.
AU - Hori, F.
AU - Hume, D.
AU - Huminiecki, L.
AU - Ilda, K.
AU - Ikawa, T.
AU - Ishizu, Y.
AU - Jankovic, B.
AU - Jia, H.
AU - Jorgensen, M.
AU - Joshi, A.
AU - Jurman, G.
AU - Kaczkowski, B.
AU - Kai, C.
AU - Kaida, K.
AU - Kajiyama, K.
AU - Kasianov, A.
AU - Kasukawa, T.
AU - Katayama, S.
AU - Kawaguchi, S.
AU - Kawai, J.
AU - Kawamoto, H.
AU - Kawamura, Y.
AU - Kawashima, T.
AU - Kempfle, J.
AU - Kenna, T.
AU - Kere, J.
AU - Khachigian, L.
AU - Kitamura, T.
AU - Klinken, Peter P.
AU - Knox, A.
AU - Kojima, S.
AU - Kondo, N.
AU - Koseki, H.
AU - Koyasu, S.
AU - Krampitz, S.
AU - Kubosaki, A.
AU - Kulakovskiy, I.
AU - Kwon, A.T.J. T.J.
AU - Laros, J.
AU - Lassmann, T.
AU - Lenhard, B.
AU - Lennartsson, A.
AU - Li, K.
AU - Lilje, B.
AU - Lipovich, L.
AU - Mackay-Sim, A.
AU - Makeev, V.
AU - Manabe, R.
AU - Mar, J.
AU - Marchand, B.
AU - Mathelier, A.
AU - Medvedeva, Y.
AU - Meehan, T.F. F.
AU - Mejhert, N.
AU - Meynert, A.
AU - Mizuno, Y.
AU - Morikawa, H.
AU - Morimoto, M.
AU - Moro, K.
AU - Motakis, E.
AU - Motohashi, H.
AU - Mummery, C.
AU - Mungall, C.J. J.
AU - Nakachi, Y.
AU - Nakahara, F.
AU - Nakamura, T.
AU - Nakamura, Y.
AU - Nakazato, K.
AU - Nozaki, T.
AU - Ogishima, S.
AU - Ohkura, N.
AU - Ohmiya, H.
AU - Ohno, H.
AU - Ohshima, M.
AU - Okada-Hatakeyama, M.
AU - Okazaki, Y.
AU - Orlando, V.
AU - Ovchinnikov, D.
AU - Pain, A.
AU - Passier, R.
AU - Persson, H.
AU - Piazza, S.
AU - Plessy, C.
AU - Pradhan-Bhatt, S.
AU - Prendergast, J.
AU - Rackham, O.
AU - Ramilowski, J.
AU - Rashid, M.
AU - Ravasi, T.
AU - Rehli, M.
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AU - Roncador, M.
AU - Roy, S.
AU - Rye, M.
AU - Saijyo, E.
AU - Sajantila, A.
AU - Saka, A.
AU - Sakaguchi, S.
AU - Sakai, M.
AU - Sandelin, A.
AU - Sato, H.
AU - Satoh, H.
AU - Savvi, S.
AU - Saxena, A.
AU - Schaeffer, U.
AU - Schmeier, S.
AU - Schmidl, C.
AU - Schneider, C.
AU - Schultes, E.A. A.
AU - Schulze-Tanzil, G.
AU - Schwegmann, A.
AU - Semple, C.
AU - Sengstag, T.
AU - Severin, J.
AU - Sheng, G.
AU - Shimoji, H.
AU - Shimoni, Y.
AU - Simon, C.
AU - Sugiyama, D.
AU - Sugiyama, T.
AU - Summers, K.
AU - Suzuki, H.
AU - Suzuki, N.
AU - Swoboda, R.
AU - T Hoen, P.
AU - Tagami, M.
AU - Takahashi, N.
AU - Takai, J.
AU - Tanaka, H.
AU - Tatsukawa, H.
AU - Tatum, Z.
AU - Taylor, M.
AU - Thompson, M.
AU - Toyoda, H.
AU - Toyoda, T.
AU - Valen, E.
AU - van de Wetering, M.
AU - van den Berg, L.
AU - van Nimwegen, E.
AU - Verardo, R.
AU - Vijayan, D.
AU - Vitezic, M.
AU - Vorontzov, I.
AU - Wasserman, W.
AU - Watanabe, S.
AU - Wells, C.
AU - Winteringham, Louise
AU - Wolvetang, E.
AU - Wood, E.J. J.
AU - Yamaguchi, Y.
AU - Yamamoto, M.
AU - Yoneda, M.
AU - Yonekura, Y.
AU - Yoshida, S.
AU - Young, R.
AU - Zabierowski, S.E. E.
AU - Zhang, P.
AU - Zhao, X.
AU - Zucchelli, S.
PY - 2014
Y1 - 2014
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U2 - 10.1101/gr.156232.113
DO - 10.1101/gr.156232.113
M3 - Article
VL - 24
SP - 708
EP - 717
JO - Genome Research
JF - Genome Research
SN - 1054-9803
IS - 4
ER -