School of Biological Sciences

2025

Chromosome-level genome assembly of the spangled emperor, Lethrinus nebulosus (Forsskål 1775)

Parata, L., Anstiss, L., de Jong, E., Doran, A., Edwards, R. J., Newman, S. J., Payet, S. D., Skepper, C. L., Wakefield, C. B., Depiazzi, A., Faseeh, I., Huet, L., Huynh, S., Missen, L., Peirce, T., Ayad, M. E., Bayer, P. E., Bennett, A. J., Burnell, S. J. & Cooper, M. K. & 10 others, Fraser, M. W., Goncalves, P., Kardailsky, A., Nester, G. M., Pearce, J., Raes, E. J., Rauschert, S., Robidart, J. C., Thorpe, E. M. & Corrigan, S., Dec 2025, In: Scientific Data. 12, 1, 9 p., 435.

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Open Access

LandFrag: A Dataset to Investigate the Effects of Forest Loss and Fragmentation on Biodiversity

Goncalves-Souza, T., Vancine, M. H., Sanders, N. J., Haddad, N. M., Cortinhas, L., Aase, A. L. T. O., de Aguiar, W. M., Aizen, M. A., Arroyo-Rodriguez, V., Baz, A., Benchimol, M., Bernard, E., Bertotto, T. J., Bispo, A. A., Bogoni, J. A., Boldorini, G. X., Bragagnolo, C., Brosi, B., Cantalice, A. S. & do Carmo, R. F. R. & 70 others, Cazeta, E., Chiarello, A. G., de la Sancha, N. U., Didham, R. K., Faria, D., Filgueiras, B., Figueira, J. E. C., Galvao, G. A., Garey, M. V., Gibb, H., Gomez-Martinez, C., Gonzalez, E., de Gusmao, R. A. F., Henry, M., de Jesus, S., Kloss, T. G., Lazaro, A., Leandro-Silva, V., de Lima, M. G., Lima, I. D. S., Lins-e-Silva, A. C. B., Mac Nally, R., Magalhaes, A. R., Magnago, L. F. S., Manu, S., Mariano-Neto, E., Mbora, D. N. M., Melo, F. P. L., Mutua, M. N., Neckel-Oliveira, S., Nemesio, A., Nogueira, A. A., Oliveira, P. M. D. A., Padua, D. G., Paes, L., de Paiva, A. B., Passamani, M., Pena, J. C., Peres, C. A., Pinho, B. X., Pons, J.-M., Prasniewski, V. M., Reinio, J., Rocha, M. D. S., Rocha-Santos, L., Rodal, M. J., Rodrigues, R. C., Safar, N. V. H., Salomao, R. P., Santos, B. A., Santos, M. N., dos Santos, J. P., Savilaakso, S., Schaefer, C. E. G. R., Silva, M. A. M., da Silva, F. R., Silva, R. J., Simonelli, M., Soto-Werschitz, A., Stireman III, J. O., Storck-Tonon, D., Szinwelski, N., Tabarelli, M., Teixeira, C. P., Totland, O., Uehara-Prado, M., Vaz-de-Mello, F. Z., Vasconcelos, H. L., Vieira, S. A. & Chase, J. M., Feb 2025, In: Global Ecology and Biogeography. 34, 2, 10 p., e70015.

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Open Access

1 Citation (Web of Science)

2024

A global dataset of diel activity patterns in insect communities

Wong, M. K. L. & Didham, R., Dec 2024, In: Scientific Data. 11, 1, 558.

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1 Citation (Scopus)

A transcriptomic dataset for investigating the Arabidopsis Unfolded Protein Response under chronic, proteotoxic endoplasmic reticulum stress

Ducloy, A., Azzopardi, M., Ivsic, C., Cueff, G., Sourdeval, D., Charif, D. & Cacas, J. L., Apr 2024, In: Data in Brief. 53, 110243.

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Open Access

1 Citation (Scopus)

Deliberately introduced dung beetles in Australia: 12 years of occurrence and abundance records from 2001 to 2022

Berson, J. D., Edwards, P. B., Ridsdill-Smith, T. J., Taylor, C. K., Anderson, D. J., Andrew, N. R., Barrow, R. A., Cousins, D. A., Emery, R. N., Fagan, L. L., Foster, R. M., Harwood, L. G., Hemmings, Z., Lewis, M. J., Lukehurst, S. S., Manger, J., Matthiessen, J. N., Vieira, M. D. C., Weston, P. A. & Didham, R. K. & 1 others, Evans, T. A., Jul 2024, In: Ecology. 105, 7, 2 p., e4328.

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1 Citation (Scopus)

Functional Traits of the World's Late Quaternary Terrestrial Mammalian Predators

Wooster, E. ., Lundgren, E., Balisi, M., Lemoine, R., Sandom, C., Svenning, J. C., Rowan, J., Jolly, C., Linley, G., Cowan, M. ., Wright, N., Westaway, D., Nimmo, D., Nichols, H. & Middleton, O., Dec 2024, In: Global Ecology and Biogeography. 33, 12, 10 p., e13909.

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Open Access

2 Citations (Web of Science)

The genome sequence of spotted medick, Medicago arabica (L.) Huds. (Fabaceae)

Royal Botanic Gardens Kew Genome Acquisition Lab, Plant Genome Sizing collective, Darwin Tree of Life Barcoding collective, Wellcome Sanger Institute Tree of Life Management, Samples and Laboratory team, Wellcome Sanger Institute Scientific Operations: Sequencing Operations, Wellcome Sanger Institute Tree of Life Core Informatics team, Tree of Life Core Informatics collective, Darwin Tree of Life Consortium, Christenhusz, M. J. M., Fay, M. F. & Leitch, I. J., 4 Nov 2024, In: Wellcome Open Research. 9, 17 p., 116.

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2022

ATLANTIC ANTS: a data set of ants in Atlantic Forests of South America

Silva, R. R., Martello, F., Feitosa, R. M., Silva, O. G. M., do Prado, L. P., Brandao, C. R. F., de Albuquerque, E. Z., Morini, M. S. C., Delabie, J. H. C., dos Santos Monteiro, E. C., Emanuel Oliveira Alves, A., Wild, A. L., Christianini, A. V., Arnhold, A., Casadei Ferreira, A., Oliveira, A. M., Santos, A. D., Galban, A., de Oliveira, A. A. & Subtil, A. G. M. & 191 others, Dias, A. M., de Carvalho Campos, A. E., Waldschimidt, A. M., Freitas, A. V. L., Avalos, A. N., Meyer, A. L. S., Sanchez-Restrepo, A. F., Suarez, A. V., Souza, A. S., Queiroz, A. C. M., Mayhe-Nunes, A. J., da Cruz Reis, A., Lopes, B. C., Guenard, B., Trad, B. M., Caitano, B., Yagound, B., Pereira-Silva, B., Fisher, B. L., Tavares, B. L. P., Moraes, B. B., Filgueiras, B. K. C., Guarda, C., Ribas, C. R., Cereto, C. E., Esberard, C. E. L., Schaefer, C. E. G. R., Paris, C. I., Bueno, C., Lasmar, C. J., da Costa-Milanez, C. B., Lutinski, C. J., Ortiz-Sepulveda, C. M., Wazema, C. T., Mariano, C. S. F., Barrera, C. A., Klunk, C. L., Santana, D. O., Larrea, D., Rother, D. C., Souza-Campana, D. R., Kayano, D. Y., Alves, D. L., Assis, D. S., Anjos, D., Franca, E. C. B., Santos, E. F., Silva, E. A., Santos, E. V., Koch, E. B., Siqueira, E. L. S., Almeida, E. A., Araujo, E. S., Villarreal, E., Becker, E., de Oliveira Canedo-Junior, E., Santos-Neto, E. A., Economo, E. P., Araujo-Oliveira, E. S., Cuezzo, F., Magalhaes, F. S., Neves, F. M., Rosumek, F. B., Dorneles, F. E., Noll, F. B., Arruda, F. V., Esteves, F. A., Ramos, F. N., Garcia, F. R. M., de Castro, F. S., Serna, F., Marcineiro, F. R., Neves, F. S., do Nascimento, G. B., de Figueiredo Jacintho, G., Camacho, G. P., Ribeiro, G. T., Lourenco, G. M., Soares, G. R., Castilho, G. A., Alves, G. P., Zurita, G. A., Machado Santos, G. H., Onody, H. C., Oliveira, H. S., Vasconcelos, H. L., Paulino-Neto, H. F., Brant, H., Rismo Coelho, I., Gomes, I. J. D. M. T. E., Leal, I. R., Dos Santos, I. A., Santos, I. C. S., Fernandes, I. O., Nascimento, I. C., Queiroz, J. M., Lattke, J. E., Majer, J., Schoereder, J. H., Dantas, J. O., Andrade-Silva, J., Diaz Guastavino, J. M., Silveira dos Santos, J., Filloy, J., Chaul, J. C. M., Lutinski, J. A., Carvalho, K. S., Ramos, K. S., Sampaio, K. L. S., Ribeiro, L. A. M., Sousa-Souto, L., Paolucci, L. N., Elizalde, L., Podgaiski, L. R., Chifflet, L., Carvalho-Leite, L. J., Calcaterra, L. A., Macedo-Reis, L. E., Magnago, L. F. S., Madureira, M. S., Silva, M. M., Pie, M. R., Uehara-Prado, M., Pizo, M. A., Pesquero, M. A., Carneiro, M. A. F., Busato, M. A., de Almeida, M. F. B., Bellocq, M. I., Tibcherani, M., Casimiro, M. S., Ronque, M. U. V., da Costa, M. M. S., Angotti, M. A., de Oliveira, M. V., Leponce, M., Imata, M. M. G., de Oliveira Martins, M. F., Antunes Ulyssea, M., do Espirito Santo, N. B., Ladino Lopez, N. M., Balbino, N. S., da Silva, N. S., Safar, N. V. H., de Andrade, P. L., Camargo, P. H. S. A., Oliveira, P. S., Dodonov, P., Luna, P., Ward, P. S., Hanisch, P. E., Silva, P. S., Divieso, R., Carvalho, R. L., Campos, R. B. F., Antoniazzi, R., Vicente, R. E., Giovenardi, R., Campos, R. I., Solar, R. R. C., Fujihara, R. T., de Jesus Santos, R., Fagundes, R., Guerrero, R. J., Probst, R. S., de Jesus, R. S., Silvestre, R., Lopez-Munoz, R. A., de Souza Ferreira-Chaline, R., Almeida, R. P. S., de Mello Pinto, S., Santoandre, S., Althoff, S. L., Ribeiro, S. P., Jory, T., Fernandes, T. T., de Oliveira Andrade, T., Pereira, T. P. L., Goncalves-Souza, T., da Silva, T. S. R., Silva, V. N. G., Lopez, V. M., Tonetti, V. R., Nacagava, V. A. F., Oliveira, V. M., Dattilo, W., DaRocha, W., Franco, W., Drose, W., Antonialli, W. & Ribeiro, M. C., Feb 2022, In: Ecology. 103, 2, 5 p., e03580.

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21 Citations (Web of Science)

2021

AusTraits, a curated plant trait database for the Australian flora

Falster, D., Gallagher, R., Wenk, E. H., Wright, I. J., Indiarto, D., Andrew, S. C., Baxter, C., Lawson, J., Allen, S., Fuchs, A., Monro, A., Kar, F., Adams, M. A., Ahrens, C. W., Alfonzetti, M., Angevin, T., Apgaua, D. M. G., Arndt, S., Atkin, O. K. & Atkinson, J. & 198 others, Auld, T., Baker, A., von Balthazar, M., Bean, A., Blackman, C. J., Bloomfield, K., Bowman, D. M. J. S., Bragg, J., Brodribb, T. J., Buckton, G., Burrows, G., Caldwell, E., Camac, J., Carpenter, R., Catford, J. A., Cawthray, G. R., Cernusak, L. A., Chandler, G., Chapman, A. R., Cheal, D., Cheesman, A. W., Chen, S. C., Choat, B., Clinton, B., Clode, P. L., Coleman, H., Cornwell, W. K., Cosgrove, M., Crisp, M., Cross, E., Crous, K. Y., Cunningham, S., Curran, T., Curtis, E., Daws, M. I., DeGabriel, J. L., Denton, M. D., Dong, N., Du, P., Duan, H., Duncan, D. H., Duncan, R. P., Duretto, M., Dwyer, J. M., Edwards, C., Esperon-Rodriguez, M., Evans, J. R., Everingham, S. E., Farrell, C., Firn, J., Fonseca, C. R., French, B. J., Frood, D., Funk, J. L., Geange, S. R., Ghannoum, O., Gleason, S. M., Gosper, C. R., Gray, E., Groom, P. K., Grootemaat, S., Gross, C., Guerin, G., Guja, L., Hahs, A. K., Harrison, M. T., Hayes, P. E., Henery, M., Hochuli, D., Howell, J., Huang, G., Hughes, L., Huisman, J., Ilic, J., Jagdish, A., Jin, D., Jordan, G., Jurado, E., Kanowski, J., Kasel, S., Kellermann, J., Kenny, B., Kohout, M., Kooyman, R. M., Kotowska, M. M., Lai, H. R., Laliberté, E., Lambers, H., Lamont, B. B., Lanfear, R., van Langevelde, F., Laughlin, D. C., Laugier-Kitchener, B. A., Laurance, S., Lehmann, C. E. R., Leigh, A., Leishman, M. R., Lenz, T., Lepschi, B., Lewis, J. D., Lim, F., Liu, U., Lord, J., Lusk, C. H., Macinnis-Ng, C., McPherson, H., Magallón, S., Manea, A., López-Martinez, A., Mayfield, M., McCarthy, J. K., Meers, T., van der Merwe, M., Metcalfe, D. J., Milberg, P., Mokany, K., Moles, A. T., Moore, B. D., Moore, N., Morgan, J. W., Morris, W., Muir, A., Munroe, S., Nicholson, Á., Nicolle, D., Nicotra, A. B., Niinemets, Ü., North, T., O’Reilly-Nugent, A., O’Sullivan, O. S., Oberle, B., Onoda, Y., Ooi, M. K. J., Osborne, C. P., Paczkowska, G., Pekin, B., Guilherme Pereira, C., Pickering, C., Pickup, M., Pollock, L. J., Poot, P., Powell, J. R., Power, S. A., Prentice, I. C., Prior, L., Prober, S. M., Read, J., Reynolds, V., Richards, A. E., Richardson, B., Roderick, M. L., Rosell, J. A., Rossetto, M., Rye, B., Rymer, P. D., Sams, M. A., Sanson, G., Sauquet, H., Schmidt, S., Schönenberger, J., Schulze, E. D., Sendall, K., Sinclair, S., Smith, B., Smith, R., Soper, F., Sparrow, B., Standish, R. J., Staples, T. L., Stephens, R., Szota, C., Taseski, G., Tasker, E., Thomas, F., Tissue, D. T., Tjoelker, M. G., Tng, D. Y. P., de Tombeur, F., Tomlinson, K., Turner, N. C., Veneklaas, E. J., Venn, S., Vesk, P., Vlasveld, C., Vorontsova, M. S., Warren, C. A., Warwick, N., Weerasinghe, L. K., Wells, J., Westoby, M., White, M., Williams, N. S. G., Wills, J., Wilson, P. G., Yates, C., Zanne, A. E., Zemunik, G. & Ziemińska, K., Dec 2021, In: Scientific Data. 8, 1, 20 p., 254.

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123 Citations (Web of Science)

Draft Genome Assembly and Transcriptome Dataset for European Turnip (Brassica rapa L. ssp. rapifera), ECD4 Carrying Clubroot Resistance

Park, S. G., Noh, E., Choi, S. R., Choi, B., Shin, I. G., Yoo, S. I., Lee, D. J., Ji, S., Kim, H. S., Hwang, Y. J., Kim, J. S., Batley, J., Lim, Y. P., Edwards, D. & Hong, C. P., 2 Jul 2021, In: Frontiers in Genetics. 12, 651298.

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4 Citations (Scopus)

Genetic variation among 481 diverse soybean accessions, inferred from genomic re-sequencing

Valliyodan, B., Brown, A. V., Wang, J., Patil, G., Liu, Y., Otyama, P. I., Nelson, R. T., Vuong, T., Song, Q., Musket, T. A., Wagner, R., Marri, P., Reddy, S., Sessions, A., Wu, X., Grant, D., Bayer, P. E., Roorkiwal, M., Varshney, R. K. & Liu, X. & 5 others, Edwards, D., Xu, D., Joshi, T., Cannon, S. B. & Nguyen, H. T., 2021, In: Scientific Data. 8, 1, 50.

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48 Citations (Scopus)

2020

Acquired salinity tolerance in rice: Plant growth dataset

Sriskantharajah, K., Osumi, S., Chuamnakthong, S., Nampei, M., Amas, J. C., Gregorio, G. B. & Ueda, A., Aug 2020, In: Data in Brief. 31, 106023.

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4 Citations (Scopus)

2019

Microbiomes of Velloziaceae from phosphorus-impoverished soils of the campos rupestres, a biodiversity hotspot

Camargo, A. P., de Souza, R. S. C., de Britto Costa, P., Gerhardt, I. R., Dante, R. A., Teodoro, G. S., Abrahão, A., Lambers, H., Carazzolle, M. F., Huntemann, M., Clum, A., Foster, B., Foster, B., Roux, S., Palaniappan, K., Varghese, N., Mukherjee, S., Reddy, T. B. K., Daum, C. & Copeland, A. & 7 others, Chen, I. M. A., Ivanova, N. N., Kyrpides, N. C., Pennacchio, C., Eloe-Fadrosh, E. A., Arruda, P. & Oliveira, R. S., 1 Dec 2019, In: Scientific Data. 6, 1, 1 p., 140.

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13 Citations (Scopus)

The mixed liver and heart transcriptome dataset of the New Zealand brushtail possum, Trichosurus vulpecula

White, D. J., Trought, K. & Hopkins, B., 1 Dec 2019, In: Data in Brief. 27, 104577.

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2 Citations (Web of Science)

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